Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lemd3Q9WU40 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lemd3Q9WU40 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lemd3Q9WU40 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms