Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Skp1Q9WTX5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Skp1Q9WTX5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms