Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkraQ9WTX2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrkraQ9WTX2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms