Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Usp18Q9WTV6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Usp18Q9WTV6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Usp18Q9WTV6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usp18Q9WTV6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Usp18Q9WTV6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Usp18Q9WTV6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Usp18Q9WTV6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Usp18Q9WTV6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usp18Q9WTV6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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