Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vax2Q9WTP9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms