Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PplQ9R269 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PplQ9R269 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PplQ9R269 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PplQ9R269 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PplQ9R269 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PplQ9R269 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PplQ9R269 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PplQ9R269 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PplQ9R269 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PplQ9R269 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms