Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TapbpQ9R233 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TapbpQ9R233 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms