Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sorbs3Q9R1Z8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sorbs3Q9R1Z8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sorbs3Q9R1Z8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms