Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc6Q9R1S7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Abcc6Q9R1S7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc6Q9R1S7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc6Q9R1S7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc6Q9R1S7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcc6Q9R1S7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc6Q9R1S7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc6Q9R1S7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc6Q9R1S7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc6Q9R1S7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Abcc6Q9R1S7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms