Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim3Q9R1R2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim3Q9R1R2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms