Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Slit2Q9R1B9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slit2Q9R1B9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slit2Q9R1B9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms