Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trex2Q9R1A9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trex2Q9R1A9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms