Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ntn3Q9R1A3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ntn3Q9R1A3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms