Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M6

Rab9a, Ras-related protein Rab-9A, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab9aQ9R0M6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab9aQ9R0M6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab9aQ9R0M6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms