Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Plod1Q9R0E2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Plod1Q9R0E2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms