Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Wdr54Q9R0D8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Wdr54Q9R0D8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Wdr54Q9R0D8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms