Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Plod2Q9R0B9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Plod2Q9R0B9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms