Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
Lamc3Q9R0B6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Lamc3Q9R0B6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms