Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek3Q9R0A5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nek3Q9R0A5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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