Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prkab1Q9R078 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkab1Q9R078 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms