Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Npas3Q9QZQ0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Npas3Q9QZQ0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms