Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms