Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ripk3Q9QZL0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ripk3Q9QZL0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms