Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phtf1Q9QZ09 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phtf1Q9QZ09 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms