Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL7

Abt1, Activator of basal transcription 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abt1Q9QYL7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Abt1Q9QYL7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abt1Q9QYL7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms