Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ndrg3Q9QYF9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ndrg3Q9QYF9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms