Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clic4Q9QYB1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clic4Q9QYB1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms