Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nphp1Q9QY53 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nphp1Q9QY53 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp1Q9QY53 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms