Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Opn4Q9QXZ9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn4Q9QXZ9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opn4Q9QXZ9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms