Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChmQ9QXG2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChmQ9QXG2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms