Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Limd1Q9QXD8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Limd1Q9QXD8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms