Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim44Q9QXA7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim44Q9QXA7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim44Q9QXA7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms