Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trpc5Q9QX29 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trpc5Q9QX29 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trpc5Q9QX29 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trpc5Q9QX29 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms