Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clca3a1Q9QX15 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clca3a1Q9QX15 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms