Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PdcQ9QW08 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PdcQ9QW08 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms