Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdc42ep4Q9JM96 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdc42ep4Q9JM96 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms