Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrfQ9JM73 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrfQ9JM73 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms