Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trpc4apQ9JLV2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trpc4apQ9JLV2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc4apQ9JLV2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc4apQ9JLV2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc4apQ9JLV2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trpc4apQ9JLV2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trpc4apQ9JLV2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms