Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod4Q9JLH8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Tmod4Q9JLH8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod4Q9JLH8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod4Q9JLH8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod4Q9JLH8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod4Q9JLH8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod4Q9JLH8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod4Q9JLH8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod4Q9JLH8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod4Q9JLH8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod4Q9JLH8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod4Q9JLH8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod4Q9JLH8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod4Q9JLH8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod4Q9JLH8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmod4Q9JLH8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms