Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Tgm1Q9JLF6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Tgm1Q9JLF6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Tgm1Q9JLF6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Tgm1Q9JLF6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Tgm1Q9JLF6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Tgm1Q9JLF6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Tgm1Q9JLF6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tgm1Q9JLF6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Tgm1Q9JLF6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tgm1Q9JLF6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms