Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nectin3Q9JLB9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin3Q9JLB9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms