Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Gde1Q9JL56 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
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Gde1Q9JL56 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Gde1Q9JL56 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Gde1Q9JL56 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
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Gde1Q9JL56 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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Gde1Q9JL56 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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Gde1Q9JL56 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gde1Q9JL56 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Gde1Q9JL56 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gde1Q9JL56 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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