Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scamp4Q9JKV5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Scamp4Q9JKV5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms