Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ldb3Q9JKS4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms