Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nova1Q9JKN6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nova1Q9JKN6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nova1Q9JKN6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms