Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx6Q9JKK1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx6Q9JKK1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms