Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK42

Pdk2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdk2Q9JK42 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pdk2Q9JK42 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdk2Q9JK42 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdk2Q9JK42 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdk2Q9JK42 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdk2Q9JK42 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdk2Q9JK42 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pdk2Q9JK42 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdk2Q9JK42 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdk2Q9JK42 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms