Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfra4Q9JJT2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfra4Q9JJT2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfra4Q9JJT2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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