Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ascl3Q9JJR7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl3Q9JJR7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms