Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctnnbip1Q9JJN6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms